Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MATN1P21941 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MATN1P21941 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MATN1P21941 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MATN1P21941 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MATN1P21941 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MATN1P21941 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MATN1P21941 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MATN1P21941 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MATN1P21941 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MATN1P21941 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MATN1P21941 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MATN1P21941 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MATN1P21941 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MATN1P21941 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MATN1P21941 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MATN1P21941 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MATN1P21941 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MATN1P21941 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MATN1P21941 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MATN1P21941 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MATN1P21941 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MATN1P21941 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MATN1P21941 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MATN1P21941 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MATN1P21941 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MATN1P21941 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MATN1P21941 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MATN1P21941 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MATN1P21941 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MATN1P21941 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MATN1P21941 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MATN1P21941 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MATN1P21941 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MATN1P21941 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MATN1P21941 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MATN1P21941 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MATN1P21941 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MATN1P21941 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MATN1P21941 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MATN1P21941 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MATN1P21941 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MATN1P21941 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MATN1P21941 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MATN1P21941 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MATN1P21941 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MATN1P21941 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MATN1P21941 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MATN1P21941 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MATN1P21941 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MATN1P21941 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MATN1P21941 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MATN1P21941 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MATN1P21941 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MATN1P21941 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MATN1P21941 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MATN1P21941 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MATN1P21941 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MATN1P21941 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MATN1P21941 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MATN1P21941 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MATN1P21941 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MATN1P21941 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MATN1P21941 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MATN1P21941 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MATN1P21941 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MATN1P21941 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MATN1P21941 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MATN1P21941 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MATN1P21941 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MATN1P21941 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MATN1P21941 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MATN1P21941 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MATN1P21941 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MATN1P21941 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MATN1P21941 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MATN1P21941 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MATN1P21941 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MATN1P21941 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MATN1P21941 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MATN1P21941 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MATN1P21941 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MATN1P21941 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MATN1P21941 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MATN1P21941 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MATN1P21941 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MATN1P21941 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MATN1P21941 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MATN1P21941 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MATN1P21941 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MATN1P21941 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MATN1P21941 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MATN1P21941 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MATN1P21941 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MATN1P21941 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MATN1P21941 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MATN1P21941 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MATN1P21941 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MATN1P21941 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MATN1P21941 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms