Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACO1P21399 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACO1P21399 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACO1P21399 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACO1P21399 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACO1P21399 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACO1P21399 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ACO1P21399 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACO1P21399 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACO1P21399 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACO1P21399 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACO1P21399 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACO1P21399 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACO1P21399 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACO1P21399 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACO1P21399 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACO1P21399 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACO1P21399 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ACO1P21399 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACO1P21399 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACO1P21399 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACO1P21399 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACO1P21399 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ACO1P21399 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACO1P21399 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ACO1P21399 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ACO1P21399 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACO1P21399 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACO1P21399 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACO1P21399 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACO1P21399 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACO1P21399 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACO1P21399 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACO1P21399 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACO1P21399 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACO1P21399 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACO1P21399 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACO1P21399 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACO1P21399 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACO1P21399 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACO1P21399 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACO1P21399 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACO1P21399 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACO1P21399 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACO1P21399 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACO1P21399 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACO1P21399 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACO1P21399 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACO1P21399 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACO1P21399 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACO1P21399 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACO1P21399 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACO1P21399 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACO1P21399 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACO1P21399 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACO1P21399 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACO1P21399 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACO1P21399 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ACO1P21399 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACO1P21399 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACO1P21399 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACO1P21399 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACO1P21399 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACO1P21399 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACO1P21399 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACO1P21399 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACO1P21399 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACO1P21399 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ACO1P21399 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACO1P21399 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACO1P21399 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACO1P21399 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACO1P21399 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACO1P21399 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACO1P21399 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ACO1P21399 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACO1P21399 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ACO1P21399 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACO1P21399 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACO1P21399 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ACO1P21399 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACO1P21399 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACO1P21399 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACO1P21399 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACO1P21399 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACO1P21399 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACO1P21399 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACO1P21399 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACO1P21399 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACO1P21399 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACO1P21399 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACO1P21399 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACO1P21399 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACO1P21399 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACO1P21399 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACO1P21399 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACO1P21399 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACO1P21399 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACO1P21399 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACO1P21399 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms