Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1D1P20393 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1D1P20393 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms