Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCLP18206 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCLP18206 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCLP18206 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCLP18206 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCLP18206 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCLP18206 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCLP18206 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCLP18206 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCLP18206 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCLP18206 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VCLP18206 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCLP18206 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCLP18206 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VCLP18206 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCLP18206 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCLP18206 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCLP18206 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VCLP18206 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCLP18206 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCLP18206 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCLP18206 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VCLP18206 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCLP18206 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCLP18206 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCLP18206 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCLP18206 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCLP18206 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCLP18206 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCLP18206 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCLP18206 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VCLP18206 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VCLP18206 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VCLP18206 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VCLP18206 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VCLP18206 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VCLP18206 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VCLP18206 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCLP18206 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCLP18206 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCLP18206 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCLP18206 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCLP18206 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VCLP18206 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCLP18206 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCLP18206 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCLP18206 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCLP18206 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VCLP18206 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VCLP18206 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VCLP18206 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VCLP18206 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VCLP18206 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VCLP18206 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VCLP18206 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VCLP18206 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCLP18206 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCLP18206 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCLP18206 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCLP18206 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCLP18206 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCLP18206 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCLP18206 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCLP18206 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCLP18206 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCLP18206 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCLP18206 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCLP18206 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCLP18206 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCLP18206 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCLP18206 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCLP18206 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCLP18206 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VCLP18206 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCLP18206 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCLP18206 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VCLP18206 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VCLP18206 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VCLP18206 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VCLP18206 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VCLP18206 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VCLP18206 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VCLP18206 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VCLP18206 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VCLP18206 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VCLP18206 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCLP18206 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCLP18206 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCLP18206 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCLP18206 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCLP18206 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCLP18206 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCLP18206 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCLP18206 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCLP18206 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCLP18206 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCLP18206 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VCLP18206 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCLP18206 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCLP18206 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms