Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB8P17481 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms