Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRAP16234 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms