Protein–RNA interactions for Protein: P13647

KRT5, Keratin, type II cytoskeletal 5, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT5P13647 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT5P13647 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT5P13647 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT5P13647 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT5P13647 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT5P13647 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT5P13647 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT5P13647 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT5P13647 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT5P13647 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT5P13647 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT5P13647 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT5P13647 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT5P13647 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT5P13647 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT5P13647 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT5P13647 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT5P13647 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT5P13647 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT5P13647 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT5P13647 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT5P13647 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT5P13647 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT5P13647 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT5P13647 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT5P13647 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT5P13647 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT5P13647 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT5P13647 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT5P13647 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT5P13647 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT5P13647 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT5P13647 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT5P13647 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT5P13647 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT5P13647 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT5P13647 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT5P13647 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT5P13647 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT5P13647 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT5P13647 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT5P13647 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT5P13647 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT5P13647 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT5P13647 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT5P13647 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT5P13647 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT5P13647 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT5P13647 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT5P13647 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT5P13647 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT5P13647 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT5P13647 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT5P13647 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT5P13647 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT5P13647 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT5P13647 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT5P13647 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT5P13647 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT5P13647 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT5P13647 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT5P13647 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT5P13647 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT5P13647 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT5P13647 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT5P13647 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT5P13647 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT5P13647 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT5P13647 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT5P13647 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT5P13647 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT5P13647 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT5P13647 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT5P13647 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT5P13647 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT5P13647 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT5P13647 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT5P13647 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT5P13647 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT5P13647 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT5P13647 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT5P13647 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT5P13647 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT5P13647 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT5P13647 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT5P13647 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT5P13647 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT5P13647 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT5P13647 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT5P13647 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT5P13647 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT5P13647 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT5P13647 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT5P13647 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT5P13647 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT5P13647 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT5P13647 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT5P13647 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT5P13647 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT5P13647 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms