Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT13P13646 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT13P13646 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT13P13646 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT13P13646 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT13P13646 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT13P13646 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT13P13646 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT13P13646 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT13P13646 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT13P13646 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT13P13646 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT13P13646 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT13P13646 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT13P13646 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT13P13646 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT13P13646 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT13P13646 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT13P13646 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT13P13646 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT13P13646 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT13P13646 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT13P13646 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT13P13646 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT13P13646 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT13P13646 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT13P13646 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT13P13646 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT13P13646 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT13P13646 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT13P13646 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT13P13646 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT13P13646 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT13P13646 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT13P13646 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT13P13646 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT13P13646 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT13P13646 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT13P13646 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT13P13646 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT13P13646 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT13P13646 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT13P13646 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT13P13646 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT13P13646 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT13P13646 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT13P13646 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT13P13646 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT13P13646 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT13P13646 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT13P13646 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT13P13646 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT13P13646 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT13P13646 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT13P13646 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT13P13646 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT13P13646 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT13P13646 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT13P13646 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT13P13646 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT13P13646 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT13P13646 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT13P13646 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT13P13646 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT13P13646 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT13P13646 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT13P13646 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT13P13646 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT13P13646 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT13P13646 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT13P13646 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT13P13646 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT13P13646 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT13P13646 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT13P13646 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT13P13646 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT13P13646 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT13P13646 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT13P13646 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT13P13646 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT13P13646 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT13P13646 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT13P13646 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT13P13646 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT13P13646 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT13P13646 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT13P13646 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT13P13646 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT13P13646 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT13P13646 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT13P13646 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT13P13646 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT13P13646 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT13P13646 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT13P13646 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT13P13646 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT13P13646 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT13P13646 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT13P13646 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT13P13646 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms