Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RLBP1P12271 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
RLBP1P12271 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RLBP1P12271 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.2 ms