Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ODC1P11926 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ODC1P11926 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ODC1P11926 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ODC1P11926 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ODC1P11926 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ODC1P11926 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ODC1P11926 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ODC1P11926 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ODC1P11926 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ODC1P11926 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ODC1P11926 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ODC1P11926 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ODC1P11926 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ODC1P11926 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ODC1P11926 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ODC1P11926 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ODC1P11926 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ODC1P11926 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ODC1P11926 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ODC1P11926 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ODC1P11926 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ODC1P11926 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ODC1P11926 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ODC1P11926 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ODC1P11926 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ODC1P11926 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ODC1P11926 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ODC1P11926 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ODC1P11926 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ODC1P11926 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ODC1P11926 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ODC1P11926 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ODC1P11926 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ODC1P11926 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ODC1P11926 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ODC1P11926 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ODC1P11926 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ODC1P11926 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ODC1P11926 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ODC1P11926 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ODC1P11926 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ODC1P11926 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ODC1P11926 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ODC1P11926 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ODC1P11926 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ODC1P11926 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ODC1P11926 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ODC1P11926 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ODC1P11926 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ODC1P11926 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ODC1P11926 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ODC1P11926 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ODC1P11926 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ODC1P11926 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ODC1P11926 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ODC1P11926 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ODC1P11926 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ODC1P11926 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ODC1P11926 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ODC1P11926 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ODC1P11926 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ODC1P11926 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ODC1P11926 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ODC1P11926 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ODC1P11926 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ODC1P11926 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ODC1P11926 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ODC1P11926 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ODC1P11926 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ODC1P11926 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ODC1P11926 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ODC1P11926 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ODC1P11926 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ODC1P11926 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ODC1P11926 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ODC1P11926 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ODC1P11926 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ODC1P11926 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ODC1P11926 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ODC1P11926 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ODC1P11926 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ODC1P11926 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ODC1P11926 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ODC1P11926 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ODC1P11926 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ODC1P11926 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ODC1P11926 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ODC1P11926 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ODC1P11926 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ODC1P11926 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ODC1P11926 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ODC1P11926 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ODC1P11926 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ODC1P11926 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ODC1P11926 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ODC1P11926 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ODC1P11926 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ODC1P11926 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ODC1P11926 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms