Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRM1P11229 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRM1P11229 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRM1P11229 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRM1P11229 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRM1P11229 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRM1P11229 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRM1P11229 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRM1P11229 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRM1P11229 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRM1P11229 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRM1P11229 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRM1P11229 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRM1P11229 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRM1P11229 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRM1P11229 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRM1P11229 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRM1P11229 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRM1P11229 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms