Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
THRAP10827 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
THRAP10827 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
THRAP10827 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
THRAP10827 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
THRAP10827 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THRAP10827 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THRAP10827 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THRAP10827 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
THRAP10827 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THRAP10827 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THRAP10827 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
THRAP10827 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THRAP10827 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THRAP10827 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
THRAP10827 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THRAP10827 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THRAP10827 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THRAP10827 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
THRAP10827 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
THRAP10827 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
THRAP10827 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
THRAP10827 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
THRAP10827 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THRAP10827 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THRAP10827 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THRAP10827 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THRAP10827 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THRAP10827 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THRAP10827 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THRAP10827 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THRAP10827 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THRAP10827 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THRAP10827 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THRAP10827 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THRAP10827 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THRAP10827 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THRAP10827 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THRAP10827 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THRAP10827 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
THRAP10827 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
THRAP10827 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
THRAP10827 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
THRAP10827 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
THRAP10827 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
THRAP10827 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
THRAP10827 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
THRAP10827 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
THRAP10827 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THRAP10827 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THRAP10827 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THRAP10827 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THRAP10827 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THRAP10827 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THRAP10827 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THRAP10827 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THRAP10827 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
THRAP10827 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THRAP10827 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
THRAP10827 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
THRAP10827 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
THRAP10827 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
THRAP10827 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THRAP10827 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THRAP10827 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THRAP10827 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THRAP10827 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THRAP10827 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
THRAP10827 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THRAP10827 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
THRAP10827 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
THRAP10827 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
THRAP10827 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP10827 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP10827 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP10827 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP10827 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THRAP10827 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THRAP10827 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THRAP10827 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THRAP10827 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP10827 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP10827 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP10827 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP10827 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP10827 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP10827 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP10827 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP10827 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP10827 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP10827 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP10827 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP10827 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP10827 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THRAP10827 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THRAP10827 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THRAP10827 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THRAP10827 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
THRAP10827 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THRAP10827 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms