Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR2F1P10589 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms