Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARAP10276 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARAP10276 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARAP10276 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARAP10276 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARAP10276 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARAP10276 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARAP10276 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RARAP10276 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARAP10276 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARAP10276 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARAP10276 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARAP10276 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARAP10276 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARAP10276 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARAP10276 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARAP10276 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARAP10276 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARAP10276 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RARAP10276 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARAP10276 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARAP10276 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARAP10276 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARAP10276 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARAP10276 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARAP10276 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARAP10276 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARAP10276 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARAP10276 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARAP10276 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARAP10276 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARAP10276 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARAP10276 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARAP10276 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARAP10276 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARAP10276 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARAP10276 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARAP10276 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARAP10276 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARAP10276 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RARAP10276 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARAP10276 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARAP10276 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARAP10276 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARAP10276 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RARAP10276 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RARAP10276 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARAP10276 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARAP10276 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARAP10276 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARAP10276 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARAP10276 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARAP10276 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARAP10276 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARAP10276 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARAP10276 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARAP10276 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARAP10276 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARAP10276 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARAP10276 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RARAP10276 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RARAP10276 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARAP10276 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARAP10276 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARAP10276 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARAP10276 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARAP10276 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARAP10276 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARAP10276 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RARAP10276 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARAP10276 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARAP10276 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARAP10276 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARAP10276 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARAP10276 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARAP10276 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARAP10276 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARAP10276 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARAP10276 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARAP10276 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARAP10276 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARAP10276 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARAP10276 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARAP10276 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARAP10276 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARAP10276 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARAP10276 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARAP10276 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARAP10276 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARAP10276 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARAP10276 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARAP10276 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARAP10276 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARAP10276 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARAP10276 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARAP10276 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARAP10276 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARAP10276 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARAP10276 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARAP10276 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193 ms