Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM10L1P0DMW3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM10L1P0DMW3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM10L1P0DMW3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM10L1P0DMW3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms