Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PGA3P0DJD8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGA3P0DJD8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms