Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC172P0C7W6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC172P0C7W6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms