Protein–RNA interactions for Protein: P04264

KRT1, Keratin, type II cytoskeletal 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT1P04264 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT1P04264 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT1P04264 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT1P04264 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT1P04264 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT1P04264 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT1P04264 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT1P04264 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT1P04264 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT1P04264 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT1P04264 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT1P04264 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT1P04264 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT1P04264 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT1P04264 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT1P04264 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT1P04264 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT1P04264 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT1P04264 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT1P04264 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT1P04264 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT1P04264 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT1P04264 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT1P04264 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT1P04264 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT1P04264 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT1P04264 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT1P04264 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT1P04264 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT1P04264 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT1P04264 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT1P04264 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT1P04264 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT1P04264 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT1P04264 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT1P04264 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT1P04264 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT1P04264 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT1P04264 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT1P04264 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT1P04264 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT1P04264 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT1P04264 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT1P04264 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT1P04264 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT1P04264 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT1P04264 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT1P04264 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT1P04264 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT1P04264 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT1P04264 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT1P04264 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT1P04264 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT1P04264 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT1P04264 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT1P04264 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT1P04264 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT1P04264 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT1P04264 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT1P04264 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT1P04264 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT1P04264 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT1P04264 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT1P04264 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT1P04264 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT1P04264 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT1P04264 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT1P04264 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT1P04264 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT1P04264 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT1P04264 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT1P04264 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT1P04264 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT1P04264 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT1P04264 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT1P04264 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT1P04264 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT1P04264 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT1P04264 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT1P04264 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT1P04264 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT1P04264 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT1P04264 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT1P04264 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT1P04264 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT1P04264 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT1P04264 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT1P04264 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT1P04264 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT1P04264 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT1P04264 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT1P04264 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT1P04264 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT1P04264 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT1P04264 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT1P04264 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT1P04264 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT1P04264 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT1P04264 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT1P04264 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms