Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC1P02654 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC1P02654 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC1P02654 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC1P02654 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC1P02654 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC1P02654 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC1P02654 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC1P02654 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC1P02654 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC1P02654 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC1P02654 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC1P02654 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC1P02654 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC1P02654 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC1P02654 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC1P02654 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC1P02654 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC1P02654 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC1P02654 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC1P02654 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC1P02654 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC1P02654 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC1P02654 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC1P02654 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC1P02654 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC1P02654 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC1P02654 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC1P02654 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC1P02654 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC1P02654 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC1P02654 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC1P02654 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC1P02654 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC1P02654 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC1P02654 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC1P02654 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC1P02654 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC1P02654 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC1P02654 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOC1P02654 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOC1P02654 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOC1P02654 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOC1P02654 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOC1P02654 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APOC1P02654 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOC1P02654 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOC1P02654 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOC1P02654 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOC1P02654 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOC1P02654 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC1P02654 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC1P02654 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC1P02654 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC1P02654 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC1P02654 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC1P02654 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC1P02654 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC1P02654 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC1P02654 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC1P02654 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC1P02654 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC1P02654 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC1P02654 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC1P02654 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC1P02654 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC1P02654 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC1P02654 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC1P02654 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC1P02654 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC1P02654 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC1P02654 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC1P02654 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC1P02654 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC1P02654 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC1P02654 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC1P02654 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC1P02654 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC1P02654 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC1P02654 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC1P02654 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC1P02654 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC1P02654 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC1P02654 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC1P02654 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC1P02654 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC1P02654 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC1P02654 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC1P02654 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC1P02654 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC1P02654 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC1P02654 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC1P02654 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC1P02654 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC1P02654 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC1P02654 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC1P02654 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC1P02654 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC1P02654 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC1P02654 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms