Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOEP02649 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOEP02649 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOEP02649 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOEP02649 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOEP02649 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
APOEP02649 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOEP02649 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOEP02649 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOEP02649 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOEP02649 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOEP02649 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOEP02649 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOEP02649 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOEP02649 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOEP02649 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOEP02649 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOEP02649 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOEP02649 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOEP02649 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOEP02649 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
APOEP02649 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOEP02649 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOEP02649 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOEP02649 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOEP02649 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOEP02649 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOEP02649 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOEP02649 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOEP02649 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOEP02649 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOEP02649 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOEP02649 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOEP02649 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOEP02649 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOEP02649 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOEP02649 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOEP02649 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOEP02649 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APOEP02649 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOEP02649 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOEP02649 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOEP02649 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOEP02649 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOEP02649 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
APOEP02649 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOEP02649 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOEP02649 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOEP02649 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOEP02649 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOEP02649 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOEP02649 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOEP02649 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOEP02649 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOEP02649 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOEP02649 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOEP02649 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOEP02649 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOEP02649 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOEP02649 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOEP02649 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOEP02649 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOEP02649 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOEP02649 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOEP02649 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOEP02649 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOEP02649 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOEP02649 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
APOEP02649 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOEP02649 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
APOEP02649 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOEP02649 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOEP02649 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOEP02649 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOEP02649 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOEP02649 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOEP02649 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOEP02649 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOEP02649 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOEP02649 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOEP02649 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOEP02649 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOEP02649 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOEP02649 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOEP02649 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOEP02649 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOEP02649 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOEP02649 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOEP02649 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOEP02649 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOEP02649 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOEP02649 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOEP02649 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOEP02649 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOEP02649 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
APOEP02649 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOEP02649 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOEP02649 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOEP02649 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
APOEP02649 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms