Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFNA21P01568 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IFNA21P01568 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFNA21P01568 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFNA21P01568 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms