Protein–RNA interactions for Protein: P01037

CST1, Cystatin-SN, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST1P01037 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CST1P01037 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CST1P01037 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CST1P01037 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CST1P01037 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CST1P01037 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CST1P01037 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CST1P01037 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CST1P01037 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CST1P01037 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CST1P01037 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CST1P01037 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CST1P01037 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CST1P01037 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CST1P01037 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CST1P01037 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CST1P01037 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CST1P01037 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CST1P01037 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CST1P01037 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CST1P01037 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CST1P01037 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CST1P01037 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CST1P01037 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CST1P01037 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CST1P01037 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CST1P01037 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CST1P01037 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CST1P01037 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CST1P01037 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CST1P01037 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CST1P01037 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CST1P01037 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CST1P01037 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CST1P01037 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CST1P01037 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CST1P01037 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CST1P01037 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CST1P01037 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CST1P01037 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CST1P01037 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CST1P01037 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CST1P01037 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CST1P01037 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CST1P01037 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CST1P01037 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CST1P01037 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CST1P01037 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CST1P01037 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CST1P01037 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CST1P01037 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CST1P01037 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CST1P01037 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CST1P01037 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CST1P01037 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CST1P01037 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CST1P01037 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CST1P01037 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CST1P01037 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CST1P01037 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CST1P01037 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CST1P01037 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CST1P01037 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CST1P01037 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CST1P01037 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CST1P01037 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CST1P01037 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CST1P01037 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CST1P01037 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CST1P01037 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CST1P01037 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CST1P01037 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CST1P01037 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CST1P01037 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CST1P01037 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CST1P01037 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CST1P01037 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CST1P01037 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CST1P01037 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CST1P01037 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CST1P01037 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CST1P01037 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CST1P01037 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CST1P01037 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CST1P01037 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CST1P01037 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CST1P01037 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CST1P01037 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CST1P01037 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CST1P01037 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CST1P01037 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CST1P01037 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CST1P01037 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CST1P01037 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CST1P01037 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CST1P01037 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CST1P01037 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CST1P01037 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CST1P01037 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CST1P01037 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms