Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EGFRP00533 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EGFRP00533 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
EGFRP00533 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EGFRP00533 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EGFRP00533 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EGFRP00533 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EGFRP00533 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
EGFRP00533 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EGFRP00533 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EGFRP00533 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
EGFRP00533 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EGFRP00533 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EGFRP00533 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EGFRP00533 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
EGFRP00533 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EGFRP00533 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EGFRP00533 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EGFRP00533 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EGFRP00533 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EGFRP00533 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EGFRP00533 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EGFRP00533 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
EGFRP00533 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EGFRP00533 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EGFRP00533 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EGFRP00533 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EGFRP00533 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EGFRP00533 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EGFRP00533 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EGFRP00533 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EGFRP00533 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EGFRP00533 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EGFRP00533 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EGFRP00533 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EGFRP00533 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EGFRP00533 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EGFRP00533 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EGFRP00533 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
EGFRP00533 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EGFRP00533 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EGFRP00533 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EGFRP00533 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EGFRP00533 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EGFRP00533 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EGFRP00533 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EGFRP00533 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
EGFRP00533 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
EGFRP00533 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EGFRP00533 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EGFRP00533 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EGFRP00533 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EGFRP00533 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
EGFRP00533 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EGFRP00533 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
EGFRP00533 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EGFRP00533 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EGFRP00533 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EGFRP00533 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EGFRP00533 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EGFRP00533 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EGFRP00533 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EGFRP00533 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EGFRP00533 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EGFRP00533 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EGFRP00533 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EGFRP00533 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EGFRP00533 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EGFRP00533 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EGFRP00533 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EGFRP00533 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EGFRP00533 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
EGFRP00533 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EGFRP00533 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EGFRP00533 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EGFRP00533 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
EGFRP00533 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EGFRP00533 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EGFRP00533 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EGFRP00533 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EGFRP00533 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EGFRP00533 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
EGFRP00533 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EGFRP00533 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EGFRP00533 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EGFRP00533 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EGFRP00533 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EGFRP00533 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EGFRP00533 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EGFRP00533 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EGFRP00533 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EGFRP00533 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EGFRP00533 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EGFRP00533 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EGFRP00533 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EGFRP00533 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EGFRP00533 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EGFRP00533 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
EGFRP00533 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EGFRP00533 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms