Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLIC3O95833 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIC3O95833 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLIC3O95833 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIC3O95833 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIC3O95833 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLIC3O95833 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIC3O95833 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIC3O95833 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIC3O95833 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms