Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1O95476 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1O95476 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms