Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAPLNO95428 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPLNO95428 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPLNO95428 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPLNO95428 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPLNO95428 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPLNO95428 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPLNO95428 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPLNO95428 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPLNO95428 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPLNO95428 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPLNO95428 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPLNO95428 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPLNO95428 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPLNO95428 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPLNO95428 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPLNO95428 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPLNO95428 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPLNO95428 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPLNO95428 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPLNO95428 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPLNO95428 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms