Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATE1O95260 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATE1O95260 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATE1O95260 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATE1O95260 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATE1O95260 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATE1O95260 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATE1O95260 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATE1O95260 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATE1O95260 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATE1O95260 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATE1O95260 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATE1O95260 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATE1O95260 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATE1O95260 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATE1O95260 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATE1O95260 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATE1O95260 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATE1O95260 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATE1O95260 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATE1O95260 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATE1O95260 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATE1O95260 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATE1O95260 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATE1O95260 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATE1O95260 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATE1O95260 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATE1O95260 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATE1O95260 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATE1O95260 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATE1O95260 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATE1O95260 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATE1O95260 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATE1O95260 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATE1O95260 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATE1O95260 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATE1O95260 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATE1O95260 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATE1O95260 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATE1O95260 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATE1O95260 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATE1O95260 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATE1O95260 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATE1O95260 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATE1O95260 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATE1O95260 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATE1O95260 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATE1O95260 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATE1O95260 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATE1O95260 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATE1O95260 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATE1O95260 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATE1O95260 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATE1O95260 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATE1O95260 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATE1O95260 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATE1O95260 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATE1O95260 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATE1O95260 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATE1O95260 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATE1O95260 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATE1O95260 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATE1O95260 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATE1O95260 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATE1O95260 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATE1O95260 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATE1O95260 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATE1O95260 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATE1O95260 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATE1O95260 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATE1O95260 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATE1O95260 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATE1O95260 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATE1O95260 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATE1O95260 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATE1O95260 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATE1O95260 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATE1O95260 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATE1O95260 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATE1O95260 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATE1O95260 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATE1O95260 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATE1O95260 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATE1O95260 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATE1O95260 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATE1O95260 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATE1O95260 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATE1O95260 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATE1O95260 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATE1O95260 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATE1O95260 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATE1O95260 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATE1O95260 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATE1O95260 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATE1O95260 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATE1O95260 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATE1O95260 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATE1O95260 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATE1O95260 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATE1O95260 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms