Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC24DO94855 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24DO94855 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms