Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX3O75364 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX3O75364 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX3O75364 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX3O75364 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX3O75364 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX3O75364 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX3O75364 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX3O75364 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX3O75364 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX3O75364 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX3O75364 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX3O75364 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX3O75364 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX3O75364 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX3O75364 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX3O75364 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX3O75364 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX3O75364 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX3O75364 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX3O75364 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX3O75364 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX3O75364 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX3O75364 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX3O75364 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX3O75364 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX3O75364 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX3O75364 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX3O75364 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX3O75364 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX3O75364 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX3O75364 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX3O75364 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX3O75364 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX3O75364 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX3O75364 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX3O75364 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX3O75364 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX3O75364 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PITX3O75364 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PITX3O75364 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PITX3O75364 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PITX3O75364 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PITX3O75364 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PITX3O75364 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PITX3O75364 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PITX3O75364 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PITX3O75364 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PITX3O75364 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PITX3O75364 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PITX3O75364 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PITX3O75364 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PITX3O75364 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PITX3O75364 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PITX3O75364 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX3O75364 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX3O75364 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX3O75364 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX3O75364 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX3O75364 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX3O75364 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX3O75364 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX3O75364 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX3O75364 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX3O75364 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX3O75364 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX3O75364 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX3O75364 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX3O75364 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PITX3O75364 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PITX3O75364 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PITX3O75364 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PITX3O75364 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PITX3O75364 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PITX3O75364 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX3O75364 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX3O75364 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX3O75364 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX3O75364 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX3O75364 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX3O75364 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX3O75364 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX3O75364 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX3O75364 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX3O75364 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX3O75364 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX3O75364 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX3O75364 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX3O75364 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITX3O75364 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITX3O75364 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITX3O75364 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITX3O75364 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITX3O75364 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITX3O75364 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITX3O75364 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITX3O75364 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITX3O75364 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITX3O75364 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITX3O75364 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms