Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA4O75335 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms