Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG13O75143 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG13O75143 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG13O75143 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG13O75143 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG13O75143 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG13O75143 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG13O75143 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG13O75143 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG13O75143 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG13O75143 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG13O75143 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG13O75143 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG13O75143 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG13O75143 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG13O75143 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG13O75143 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG13O75143 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG13O75143 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG13O75143 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG13O75143 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG13O75143 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG13O75143 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG13O75143 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG13O75143 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG13O75143 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG13O75143 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG13O75143 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG13O75143 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG13O75143 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATG13O75143 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATG13O75143 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG13O75143 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG13O75143 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG13O75143 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG13O75143 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG13O75143 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG13O75143 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG13O75143 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG13O75143 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG13O75143 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG13O75143 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG13O75143 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG13O75143 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG13O75143 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG13O75143 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG13O75143 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG13O75143 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG13O75143 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG13O75143 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG13O75143 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG13O75143 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG13O75143 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG13O75143 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG13O75143 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG13O75143 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG13O75143 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG13O75143 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG13O75143 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG13O75143 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG13O75143 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG13O75143 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG13O75143 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG13O75143 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG13O75143 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG13O75143 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG13O75143 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG13O75143 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG13O75143 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG13O75143 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG13O75143 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG13O75143 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG13O75143 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG13O75143 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG13O75143 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG13O75143 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG13O75143 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG13O75143 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG13O75143 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG13O75143 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG13O75143 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG13O75143 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG13O75143 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG13O75143 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG13O75143 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG13O75143 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG13O75143 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG13O75143 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG13O75143 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG13O75143 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG13O75143 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG13O75143 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG13O75143 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG13O75143 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG13O75143 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG13O75143 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG13O75143 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG13O75143 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG13O75143 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG13O75143 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms