Protein–RNA interactions for Protein: O75096

LRP4, Low-density lipoprotein receptor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP4O75096 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP4O75096 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP4O75096 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP4O75096 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP4O75096 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP4O75096 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP4O75096 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP4O75096 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP4O75096 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP4O75096 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP4O75096 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP4O75096 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP4O75096 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP4O75096 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP4O75096 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP4O75096 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP4O75096 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP4O75096 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP4O75096 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP4O75096 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP4O75096 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP4O75096 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP4O75096 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP4O75096 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP4O75096 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP4O75096 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP4O75096 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP4O75096 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP4O75096 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP4O75096 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP4O75096 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP4O75096 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP4O75096 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP4O75096 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP4O75096 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP4O75096 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP4O75096 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP4O75096 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP4O75096 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP4O75096 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP4O75096 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP4O75096 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP4O75096 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP4O75096 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP4O75096 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP4O75096 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP4O75096 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP4O75096 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP4O75096 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP4O75096 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP4O75096 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP4O75096 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP4O75096 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP4O75096 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP4O75096 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP4O75096 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP4O75096 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP4O75096 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP4O75096 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP4O75096 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP4O75096 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP4O75096 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP4O75096 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP4O75096 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP4O75096 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP4O75096 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP4O75096 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP4O75096 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP4O75096 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP4O75096 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP4O75096 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP4O75096 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP4O75096 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP4O75096 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP4O75096 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP4O75096 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRP4O75096 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRP4O75096 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
LRP4O75096 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRP4O75096 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRP4O75096 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP4O75096 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP4O75096 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP4O75096 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP4O75096 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP4O75096 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP4O75096 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP4O75096 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP4O75096 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP4O75096 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP4O75096 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP4O75096 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP4O75096 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP4O75096 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP4O75096 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP4O75096 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP4O75096 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP4O75096 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP4O75096 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP4O75096 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms