Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX2O60749 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX2O60749 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX2O60749 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX2O60749 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX2O60749 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX2O60749 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX2O60749 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX2O60749 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX2O60749 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX2O60749 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX2O60749 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX2O60749 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX2O60749 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX2O60749 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX2O60749 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX2O60749 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX2O60749 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX2O60749 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX2O60749 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX2O60749 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX2O60749 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX2O60749 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX2O60749 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX2O60749 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX2O60749 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX2O60749 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX2O60749 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX2O60749 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX2O60749 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX2O60749 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX2O60749 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX2O60749 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX2O60749 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX2O60749 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX2O60749 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX2O60749 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX2O60749 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX2O60749 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX2O60749 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX2O60749 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX2O60749 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX2O60749 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX2O60749 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX2O60749 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX2O60749 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX2O60749 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX2O60749 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX2O60749 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX2O60749 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX2O60749 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX2O60749 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX2O60749 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX2O60749 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX2O60749 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX2O60749 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX2O60749 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX2O60749 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX2O60749 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX2O60749 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX2O60749 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX2O60749 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX2O60749 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX2O60749 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX2O60749 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX2O60749 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX2O60749 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX2O60749 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX2O60749 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX2O60749 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX2O60749 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX2O60749 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX2O60749 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX2O60749 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX2O60749 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX2O60749 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX2O60749 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX2O60749 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX2O60749 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX2O60749 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX2O60749 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX2O60749 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX2O60749 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX2O60749 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX2O60749 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX2O60749 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX2O60749 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX2O60749 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX2O60749 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX2O60749 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX2O60749 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX2O60749 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX2O60749 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX2O60749 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX2O60749 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX2O60749 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX2O60749 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX2O60749 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX2O60749 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX2O60749 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms