Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK2O60296 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms