Protein–RNA interactions for Protein: O60287

URB1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB1O60287 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
URB1O60287 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
URB1O60287 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
URB1O60287 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
URB1O60287 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
URB1O60287 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
URB1O60287 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
URB1O60287 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
URB1O60287 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
URB1O60287 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
URB1O60287 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
URB1O60287 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
URB1O60287 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
URB1O60287 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
URB1O60287 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
URB1O60287 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
URB1O60287 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
URB1O60287 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
URB1O60287 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
URB1O60287 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
URB1O60287 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
URB1O60287 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
URB1O60287 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
URB1O60287 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
URB1O60287 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
URB1O60287 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
URB1O60287 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
URB1O60287 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
URB1O60287 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
URB1O60287 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
URB1O60287 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
URB1O60287 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
URB1O60287 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
URB1O60287 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
URB1O60287 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
URB1O60287 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
URB1O60287 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
URB1O60287 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
URB1O60287 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
URB1O60287 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
URB1O60287 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
URB1O60287 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
URB1O60287 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
URB1O60287 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
URB1O60287 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
URB1O60287 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
URB1O60287 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
URB1O60287 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
URB1O60287 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
URB1O60287 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
URB1O60287 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
URB1O60287 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
URB1O60287 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
URB1O60287 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
URB1O60287 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
URB1O60287 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
URB1O60287 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
URB1O60287 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
URB1O60287 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
URB1O60287 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
URB1O60287 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
URB1O60287 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
URB1O60287 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
URB1O60287 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
URB1O60287 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
URB1O60287 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
URB1O60287 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
URB1O60287 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
URB1O60287 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
URB1O60287 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
URB1O60287 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
URB1O60287 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
URB1O60287 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
URB1O60287 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
URB1O60287 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
URB1O60287 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
URB1O60287 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
URB1O60287 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
URB1O60287 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
URB1O60287 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
URB1O60287 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
URB1O60287 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
URB1O60287 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
URB1O60287 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
URB1O60287 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
URB1O60287 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
URB1O60287 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
URB1O60287 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
URB1O60287 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
URB1O60287 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
URB1O60287 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
URB1O60287 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
URB1O60287 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
URB1O60287 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
URB1O60287 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
URB1O60287 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
URB1O60287 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
URB1O60287 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
URB1O60287 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
URB1O60287 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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