Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BUD23O43709 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BUD23O43709 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BUD23O43709 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BUD23O43709 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BUD23O43709 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BUD23O43709 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BUD23O43709 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BUD23O43709 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BUD23O43709 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BUD23O43709 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BUD23O43709 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BUD23O43709 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BUD23O43709 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BUD23O43709 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BUD23O43709 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BUD23O43709 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BUD23O43709 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BUD23O43709 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BUD23O43709 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BUD23O43709 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BUD23O43709 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BUD23O43709 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BUD23O43709 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BUD23O43709 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BUD23O43709 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BUD23O43709 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BUD23O43709 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BUD23O43709 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BUD23O43709 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BUD23O43709 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BUD23O43709 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BUD23O43709 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BUD23O43709 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BUD23O43709 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BUD23O43709 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BUD23O43709 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BUD23O43709 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BUD23O43709 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BUD23O43709 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BUD23O43709 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BUD23O43709 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BUD23O43709 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BUD23O43709 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BUD23O43709 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BUD23O43709 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BUD23O43709 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BUD23O43709 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BUD23O43709 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BUD23O43709 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BUD23O43709 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BUD23O43709 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BUD23O43709 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BUD23O43709 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BUD23O43709 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BUD23O43709 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BUD23O43709 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BUD23O43709 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BUD23O43709 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BUD23O43709 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BUD23O43709 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BUD23O43709 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BUD23O43709 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BUD23O43709 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BUD23O43709 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BUD23O43709 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BUD23O43709 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BUD23O43709 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BUD23O43709 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BUD23O43709 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BUD23O43709 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BUD23O43709 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BUD23O43709 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BUD23O43709 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BUD23O43709 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BUD23O43709 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BUD23O43709 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BUD23O43709 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BUD23O43709 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BUD23O43709 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BUD23O43709 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BUD23O43709 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BUD23O43709 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BUD23O43709 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BUD23O43709 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BUD23O43709 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BUD23O43709 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BUD23O43709 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BUD23O43709 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BUD23O43709 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BUD23O43709 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BUD23O43709 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BUD23O43709 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BUD23O43709 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BUD23O43709 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BUD23O43709 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BUD23O43709 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BUD23O43709 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BUD23O43709 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BUD23O43709 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms