Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRC1O43663 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRC1O43663 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRC1O43663 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRC1O43663 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRC1O43663 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRC1O43663 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRC1O43663 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRC1O43663 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRC1O43663 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRC1O43663 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRC1O43663 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRC1O43663 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRC1O43663 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRC1O43663 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRC1O43663 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRC1O43663 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PRC1O43663 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRC1O43663 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRC1O43663 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRC1O43663 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRC1O43663 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRC1O43663 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRC1O43663 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRC1O43663 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRC1O43663 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRC1O43663 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRC1O43663 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRC1O43663 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRC1O43663 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRC1O43663 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRC1O43663 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRC1O43663 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRC1O43663 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRC1O43663 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRC1O43663 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRC1O43663 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRC1O43663 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRC1O43663 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRC1O43663 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRC1O43663 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRC1O43663 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRC1O43663 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRC1O43663 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRC1O43663 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRC1O43663 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRC1O43663 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PRC1O43663 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRC1O43663 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PRC1O43663 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRC1O43663 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRC1O43663 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRC1O43663 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRC1O43663 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRC1O43663 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRC1O43663 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRC1O43663 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRC1O43663 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRC1O43663 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRC1O43663 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRC1O43663 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRC1O43663 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRC1O43663 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRC1O43663 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRC1O43663 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRC1O43663 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRC1O43663 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PRC1O43663 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRC1O43663 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRC1O43663 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRC1O43663 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRC1O43663 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRC1O43663 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRC1O43663 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRC1O43663 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRC1O43663 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRC1O43663 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PRC1O43663 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRC1O43663 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRC1O43663 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRC1O43663 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRC1O43663 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRC1O43663 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRC1O43663 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRC1O43663 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRC1O43663 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRC1O43663 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRC1O43663 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRC1O43663 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRC1O43663 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRC1O43663 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRC1O43663 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRC1O43663 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRC1O43663 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRC1O43663 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRC1O43663 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRC1O43663 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRC1O43663 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRC1O43663 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRC1O43663 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms