Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC3O43617 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms