Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCXO43602 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCXO43602 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DCXO43602 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCXO43602 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCXO43602 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCXO43602 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCXO43602 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCXO43602 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCXO43602 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCXO43602 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DCXO43602 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCXO43602 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCXO43602 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCXO43602 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DCXO43602 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DCXO43602 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCXO43602 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCXO43602 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCXO43602 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCXO43602 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DCXO43602 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCXO43602 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCXO43602 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCXO43602 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCXO43602 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCXO43602 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCXO43602 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCXO43602 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCXO43602 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCXO43602 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCXO43602 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCXO43602 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCXO43602 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCXO43602 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCXO43602 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCXO43602 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCXO43602 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCXO43602 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCXO43602 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCXO43602 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCXO43602 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCXO43602 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCXO43602 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCXO43602 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCXO43602 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCXO43602 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCXO43602 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCXO43602 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DCXO43602 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCXO43602 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DCXO43602 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCXO43602 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCXO43602 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCXO43602 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCXO43602 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCXO43602 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCXO43602 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCXO43602 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCXO43602 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCXO43602 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCXO43602 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCXO43602 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCXO43602 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCXO43602 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCXO43602 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCXO43602 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCXO43602 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCXO43602 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCXO43602 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCXO43602 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCXO43602 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCXO43602 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCXO43602 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCXO43602 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCXO43602 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCXO43602 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCXO43602 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCXO43602 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCXO43602 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCXO43602 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCXO43602 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCXO43602 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCXO43602 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCXO43602 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCXO43602 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCXO43602 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCXO43602 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCXO43602 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DCXO43602 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCXO43602 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCXO43602 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCXO43602 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCXO43602 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCXO43602 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCXO43602 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCXO43602 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCXO43602 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCXO43602 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCXO43602 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms