Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF14O43557 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF14O43557 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF14O43557 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF14O43557 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF14O43557 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF14O43557 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF14O43557 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF14O43557 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF14O43557 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF14O43557 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF14O43557 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF14O43557 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF14O43557 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF14O43557 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF14O43557 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF14O43557 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF14O43557 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF14O43557 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF14O43557 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF14O43557 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms