Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD51CO43502 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD51CO43502 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms