Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATMINO43313 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATMINO43313 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATMINO43313 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATMINO43313 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATMINO43313 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATMINO43313 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATMINO43313 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATMINO43313 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATMINO43313 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATMINO43313 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATMINO43313 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATMINO43313 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATMINO43313 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATMINO43313 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATMINO43313 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATMINO43313 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATMINO43313 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATMINO43313 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATMINO43313 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATMINO43313 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATMINO43313 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATMINO43313 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATMINO43313 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATMINO43313 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATMINO43313 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATMINO43313 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATMINO43313 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATMINO43313 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATMINO43313 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATMINO43313 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATMINO43313 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATMINO43313 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATMINO43313 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATMINO43313 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATMINO43313 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATMINO43313 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATMINO43313 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATMINO43313 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATMINO43313 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATMINO43313 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATMINO43313 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATMINO43313 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATMINO43313 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATMINO43313 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATMINO43313 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATMINO43313 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATMINO43313 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATMINO43313 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATMINO43313 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATMINO43313 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATMINO43313 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATMINO43313 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATMINO43313 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATMINO43313 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATMINO43313 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATMINO43313 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATMINO43313 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATMINO43313 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATMINO43313 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATMINO43313 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATMINO43313 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATMINO43313 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATMINO43313 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATMINO43313 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATMINO43313 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATMINO43313 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATMINO43313 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATMINO43313 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATMINO43313 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATMINO43313 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATMINO43313 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATMINO43313 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATMINO43313 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATMINO43313 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATMINO43313 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATMINO43313 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATMINO43313 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATMINO43313 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATMINO43313 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATMINO43313 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATMINO43313 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATMINO43313 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATMINO43313 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATMINO43313 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATMINO43313 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATMINO43313 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATMINO43313 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATMINO43313 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATMINO43313 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATMINO43313 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATMINO43313 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATMINO43313 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATMINO43313 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATMINO43313 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATMINO43313 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATMINO43313 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATMINO43313 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATMINO43313 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATMINO43313 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms