Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTSS1O43312 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
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