Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MAP3K13O43283 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MAP3K13O43283 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MAP3K13O43283 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MAP3K13O43283 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MAP3K13O43283 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MAP3K13O43283 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MAP3K13O43283 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MAP3K13O43283 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MAP3K13O43283 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MAP3K13O43283 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K13O43283 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms