Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NDUFS4O43181 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDUFS4O43181 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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