Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.7 ms