Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBDO15205 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBDO15205 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBDO15205 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBDO15205 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBDO15205 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBDO15205 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBDO15205 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBDO15205 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBDO15205 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBDO15205 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBDO15205 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBDO15205 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBDO15205 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBDO15205 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBDO15205 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBDO15205 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBDO15205 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBDO15205 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBDO15205 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBDO15205 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBDO15205 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBDO15205 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBDO15205 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBDO15205 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBDO15205 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBDO15205 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBDO15205 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBDO15205 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBDO15205 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBDO15205 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBDO15205 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBDO15205 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBDO15205 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBDO15205 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBDO15205 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBDO15205 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBDO15205 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBDO15205 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBDO15205 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBDO15205 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBDO15205 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBDO15205 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBDO15205 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBDO15205 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBDO15205 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBDO15205 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBDO15205 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBDO15205 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBDO15205 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBDO15205 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBDO15205 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBDO15205 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBDO15205 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBDO15205 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBDO15205 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBDO15205 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBDO15205 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBDO15205 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBDO15205 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBDO15205 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBDO15205 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBDO15205 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBDO15205 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBDO15205 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBDO15205 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBDO15205 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBDO15205 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBDO15205 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBDO15205 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBDO15205 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBDO15205 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBDO15205 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBDO15205 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBDO15205 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBDO15205 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBDO15205 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBDO15205 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBDO15205 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBDO15205 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBDO15205 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBDO15205 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBDO15205 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBDO15205 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBDO15205 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBDO15205 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBDO15205 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBDO15205 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBDO15205 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBDO15205 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBDO15205 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBDO15205 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBDO15205 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBDO15205 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBDO15205 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBDO15205 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBDO15205 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBDO15205 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBDO15205 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBDO15205 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms