Protein–RNA interactions for Protein: O14842

FFAR1, Free fatty acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR1O14842 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FFAR1O14842 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FFAR1O14842 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FFAR1O14842 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FFAR1O14842 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FFAR1O14842 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FFAR1O14842 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FFAR1O14842 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FFAR1O14842 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FFAR1O14842 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FFAR1O14842 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FFAR1O14842 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FFAR1O14842 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FFAR1O14842 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FFAR1O14842 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FFAR1O14842 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FFAR1O14842 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FFAR1O14842 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FFAR1O14842 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FFAR1O14842 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FFAR1O14842 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FFAR1O14842 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FFAR1O14842 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FFAR1O14842 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FFAR1O14842 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FFAR1O14842 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FFAR1O14842 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FFAR1O14842 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FFAR1O14842 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FFAR1O14842 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FFAR1O14842 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FFAR1O14842 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FFAR1O14842 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FFAR1O14842 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FFAR1O14842 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FFAR1O14842 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FFAR1O14842 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FFAR1O14842 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FFAR1O14842 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FFAR1O14842 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FFAR1O14842 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FFAR1O14842 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FFAR1O14842 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FFAR1O14842 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FFAR1O14842 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FFAR1O14842 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FFAR1O14842 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FFAR1O14842 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FFAR1O14842 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FFAR1O14842 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FFAR1O14842 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FFAR1O14842 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FFAR1O14842 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FFAR1O14842 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FFAR1O14842 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FFAR1O14842 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FFAR1O14842 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FFAR1O14842 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FFAR1O14842 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FFAR1O14842 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FFAR1O14842 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FFAR1O14842 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FFAR1O14842 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FFAR1O14842 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FFAR1O14842 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FFAR1O14842 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FFAR1O14842 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FFAR1O14842 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FFAR1O14842 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FFAR1O14842 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FFAR1O14842 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FFAR1O14842 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FFAR1O14842 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms