Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F3O00716 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F3O00716 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F3O00716 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F3O00716 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
E2F3O00716 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
E2F3O00716 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
E2F3O00716 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
E2F3O00716 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F3O00716 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F3O00716 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F3O00716 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F3O00716 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F3O00716 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F3O00716 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F3O00716 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F3O00716 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F3O00716 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F3O00716 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F3O00716 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F3O00716 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F3O00716 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F3O00716 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F3O00716 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F3O00716 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F3O00716 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F3O00716 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F3O00716 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F3O00716 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F3O00716 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F3O00716 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F3O00716 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F3O00716 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F3O00716 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F3O00716 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F3O00716 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F3O00716 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F3O00716 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F3O00716 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F3O00716 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F3O00716 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F3O00716 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F3O00716 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F3O00716 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F3O00716 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F3O00716 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F3O00716 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F3O00716 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F3O00716 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F3O00716 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F3O00716 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F3O00716 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F3O00716 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F3O00716 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F3O00716 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F3O00716 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F3O00716 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F3O00716 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F3O00716 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F3O00716 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F3O00716 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F3O00716 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F3O00716 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F3O00716 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F3O00716 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F3O00716 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F3O00716 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F3O00716 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F3O00716 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F3O00716 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F3O00716 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F3O00716 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F3O00716 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F3O00716 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
E2F3O00716 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F3O00716 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F3O00716 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F3O00716 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F3O00716 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F3O00716 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F3O00716 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F3O00716 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F3O00716 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F3O00716 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F3O00716 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F3O00716 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F3O00716 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F3O00716 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F3O00716 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F3O00716 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F3O00716 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F3O00716 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F3O00716 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F3O00716 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F3O00716 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F3O00716 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F3O00716 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F3O00716 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F3O00716 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F3O00716 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms