Protein–RNA interactions for Protein: H3BPM6

MKRN2OS, MKRN2 opposite strand protein, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2OSH3BPM6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN2OSH3BPM6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN2OSH3BPM6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN2OSH3BPM6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN2OSH3BPM6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN2OSH3BPM6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN2OSH3BPM6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN2OSH3BPM6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN2OSH3BPM6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN2OSH3BPM6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN2OSH3BPM6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN2OSH3BPM6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MKRN2OSH3BPM6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN2OSH3BPM6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MKRN2OSH3BPM6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MKRN2OSH3BPM6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN2OSH3BPM6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MKRN2OSH3BPM6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN2OSH3BPM6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN2OSH3BPM6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN2OSH3BPM6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN2OSH3BPM6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN2OSH3BPM6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN2OSH3BPM6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN2OSH3BPM6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN2OSH3BPM6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN2OSH3BPM6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN2OSH3BPM6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN2OSH3BPM6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN2OSH3BPM6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN2OSH3BPM6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN2OSH3BPM6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MKRN2OSH3BPM6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN2OSH3BPM6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN2OSH3BPM6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN2OSH3BPM6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN2OSH3BPM6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 249.5 ms